60秒完成基因比對(duì)工作 阿里云免費(fèi)向全球機(jī)構(gòu)開(kāi)放病毒檢測(cè)技術(shù)

來(lái)源：云棲號(hào)資訊 發(fā)布時(shí)間：2020-03-26瀏覽：2651次

60秒完成基因比對(duì)工作 阿里云免費(fèi)向全球機(jī)構(gòu)開(kāi)放病毒檢測(cè)技術(shù)

全球疫情肆虐，各大科技公司都在竭盡全力抗擊疫情。

3月13日，阿里云對(duì)外宣布，將向全球醫(yī)療科研機(jī)構(gòu)、疾控中心等一線病毒研究機(jī)構(gòu)免費(fèi)開(kāi)放病毒比對(duì)服務(wù)，可大幅提升病毒基因檢測(cè)效率，最快只需60秒即可完成包括新冠病毒在內(nèi)的任意病毒基因?qū)Ρ裙ぷ?，?duì)進(jìn)一步了解病毒變異提供有效依據(jù)。這是繼此前宣布AI算力免費(fèi)后，阿里云再次用技術(shù)“搶奪”寶貴時(shí)間。

病毒經(jīng)過(guò)數(shù)代傳播，會(huì)產(chǎn)生變異，追蹤掌握病毒變異情況成為科研人員的重中之重。宏基因組測(cè)序mNGS是目前較為有效的追蹤方案，配合病毒庫(kù)可精準(zhǔn)確定病毒的代際關(guān)系，甚至找到病毒源發(fā)地。

但此前的mNGS數(shù)據(jù)分析較為耗時(shí)，以某新冠重癥患者為例，系統(tǒng)需要對(duì)2200萬(wàn)個(gè)序列超過(guò)32億個(gè)堿基一一和病毒庫(kù)比對(duì)，檢測(cè)出新冠病毒特征區(qū)域的完全匹配系列，通常這一過(guò)程需要30分鐘或更久。

此次阿里云免費(fèi)開(kāi)放的基因計(jì)算服務(wù)AGS（Alibaba Genomics Service），采用容器技術(shù)和GPU，即開(kāi)即用，可同時(shí)運(yùn)行多個(gè)病毒基因比對(duì)服務(wù)，大大縮短了這一進(jìn)程，60秒內(nèi)即可獲取高質(zhì)量的基因比對(duì)報(bào)告，為患者提供更為準(zhǔn)確的醫(yī)療方案。

包括疾控中心、各大高校、醫(yī)院、基因企業(yè)等一線病毒研究機(jī)構(gòu)可在阿里云上申請(qǐng)快速開(kāi)通基因計(jì)算服務(wù)，為進(jìn)一步研究病毒蛋白質(zhì)及變異提供準(zhǔn)確的數(shù)據(jù)支撐。

目前，國(guó)內(nèi)基因公司安諾優(yōu)達(dá)已開(kāi)始借助阿里云的計(jì)算能力從某腫瘤樣本數(shù)據(jù)中尋找病毒相關(guān)序列的數(shù)據(jù)，用于研究病毒活動(dòng)與某腫瘤發(fā)生的相關(guān)性。

具體使用文檔：
https://help.aliyun.com/document_detail/157123.html

以下兩種申請(qǐng)方式均可

1 發(fā)郵件至 zhuanghuai.lp@alibaba-inc.com

2 或填寫(xiě)阿里云基因服務(wù)公測(cè)申請(qǐng)，在項(xiàng)目背景中備注 “用于病毒檢測(cè)”